Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCR4P51679 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCR4P51679 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms