Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRIP1P50238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms