Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP153P49790 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP153P49790 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP153P49790 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP153P49790 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP153P49790 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP153P49790 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP153P49790 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP153P49790 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUP153P49790 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP153P49790 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP153P49790 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP153P49790 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP153P49790 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP153P49790 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP153P49790 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP153P49790 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP153P49790 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms