Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP4P49662 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP4P49662 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms