Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPFP49454 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms