Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM4P49221 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM4P49221 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM4P49221 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM4P49221 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms