Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NESP48681 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NESP48681 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NESP48681 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NESP48681 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NESP48681 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NESP48681 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NESP48681 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NESP48681 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NESP48681 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NESP48681 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NESP48681 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NESP48681 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NESP48681 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NESP48681 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NESP48681 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NESP48681 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NESP48681 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NESP48681 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NESP48681 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.01
NESP48681 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms