Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL29P47914 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL29P47914 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL29P47914 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms