Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRXP46100 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRXP46100 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms