Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms