Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCAP37840 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms