Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACVR1BP36896 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms