Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms