Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6BP35913 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6BP35913 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms