Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD12P35452 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms