Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BMI1P35226 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BMI1P35226 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BMI1P35226 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BMI1P35226 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms