Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms