Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL9P32969 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL9P32969 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL9P32969 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL9P32969 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL9P32969 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL9P32969 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL9P32969 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL9P32969 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms