Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms