Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms