Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC27P30260 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC27P30260 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC27P30260 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC27P30260 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms