Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms