Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms