Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTAFRP25105 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms