Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms