Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms