Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTMSP20962 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTMSP20962 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTMSP20962 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTMSP20962 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTMSP20962 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTMSP20962 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms