Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms