Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms