Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD44P16070 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD44P16070 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD44P16070 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD44P16070 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD44P16070 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms