Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT13P13646 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT13P13646 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT13P13646 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT13P13646 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT13P13646 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT13P13646 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT13P13646 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT13P13646 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms