Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRFP10586 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRFP10586 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms