Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBTFL1P0CB47 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFL1P0CB47 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms