Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB7P09629 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms