Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP10P09238 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP10P09238 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP10P09238 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms