Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPM2P07951 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms