Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYBBP04839 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYBBP04839 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYBBP04839 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYBBP04839 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYBBP04839 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYBBP04839 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms