Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A1P02462 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A1P02462 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A1P02462 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms