Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms