Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms