Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP2O95045 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP2O95045 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP2O95045 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP2O95045 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP2O95045 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP2O95045 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP2O95045 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP2O95045 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP2O95045 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms