Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA2O94983 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA2O94983 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms