Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DYSFO75923 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms