Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms