Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIN3BO75182 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms