Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP3O75154 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms