Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms