Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM20BO75063 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms