Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MITFO75030 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MITFO75030 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MITFO75030 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms