Protein–RNA interactions for Protein: O60663

LMX1B, LIM homeobox transcription factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1BO60663 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMX1BO60663 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms